Categorical Data¶
版本0.15中的新功能。
注意
虽然在早期版本中有pandas.Categorical,在系列和DataFrame中使用分类数据的功能是新功能。
这是对pandas分类数据类型的简介,包括与R的factor
的短暂比较。
分类是与统计中的分类变量相对应的熊猫数据类型:一个变量,只能包含有限的,通常固定的可能值(类别 ; R中的电平)。例如性别,社会阶层,血型,国家关系,观察时间或通过Likert量表评分。
与统计分类变量相反,分类数据可能有顺序(例如“强同意”与“同意”或“第一次观察”与“第二次观察”),但数值运算(加法,除法,...)可能。
分类数据的所有值均位于类别或np.nan中。顺序由类别的顺序定义,而不是值的词汇顺序。在内部,数据结构由类别数组和代码的整数数组组成,它指向类别数组中的实际值。
分类数据类型在以下情况下很有用:
- 一个字符串变量,只包含几个不同的值。将此类字符串变量转换为分类变量将会节省一些内存,请参见here。
- 变量的词法顺序与逻辑顺序(“一个”,“两个”,“三个”)不同。通过转换为分类并在类别上指定顺序,排序和最小/最大将使用逻辑顺序而不是词法顺序,请参见here。
- 作为一个信号给其他python库,这个列应该被当作一个分类变量(例如使用合适的统计方法或图类型)。
Object Creation¶
分类系列或DataFrame中的列可以通过以下几种方式创建:
在构建系列时指定dtype="category"
:
In [1]: s = pd.Series(["a","b","c","a"], dtype="category")
In [2]: s
Out[2]:
0 a
1 b
2 c
3 a
dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
将现有的系列或列转换为category
dtype:
In [3]: df = pd.DataFrame({"A":["a","b","c","a"]})
In [4]: df["B"] = df["A"].astype('category')
In [5]: df
Out[5]:
A B
0 a a
1 b b
2 c c
3 a a
通过使用一些特殊功能:
In [6]: df = pd.DataFrame({'value': np.random.randint(0, 100, 20)})
In [7]: labels = [ "{0} - {1}".format(i, i + 9) for i in range(0, 100, 10) ]
In [8]: df['group'] = pd.cut(df.value, range(0, 105, 10), right=False, labels=labels)
In [9]: df.head(10)
Out[9]:
value group
0 65 60 - 69
1 49 40 - 49
2 56 50 - 59
3 43 40 - 49
4 43 40 - 49
5 91 90 - 99
6 32 30 - 39
7 87 80 - 89
8 36 30 - 39
9 8 0 - 9
有关cut()
的信息,请参阅documentation。
将pandas.Categorical
对象传递到系列或将其分配给DataFrame。
In [10]: raw_cat = pd.Categorical(["a","b","c","a"], categories=["b","c","d"],
....: ordered=False)
....:
In [11]: s = pd.Series(raw_cat)
In [12]: s
Out[12]:
0 NaN
1 b
2 c
3 NaN
dtype: category
Categories (3, object): [b, c, d]
In [13]: df = pd.DataFrame({"A":["a","b","c","a"]})
In [14]: df["B"] = raw_cat
In [15]: df
Out[15]:
A B
0 a NaN
1 b b
2 c c
3 a NaN
您还可以通过将这些参数传递到astype()
来指定不同排序的类别或将结果数据排序:
In [16]: s = pd.Series(["a","b","c","a"])
In [17]: s_cat = s.astype("category", categories=["b","c","d"], ordered=False)
In [18]: s_cat
Out[18]:
0 NaN
1 b
2 c
3 NaN
dtype: category
Categories (3, object): [b, c, d]
分类数据具有特定的category
dtype:
In [19]: df.dtypes
Out[19]:
A object
B category
dtype: object
注意
与R的因子函数相反,分类数据不会将输入值转换为字符串,类别将最终与原始值具有相同的数据类型。
注意
与R的因子函数相反,当前没有办法在创建时分配/更改标签。使用类别可在创建时间后更改类别。
要返回原始系列或numpy数组,请使用Series.astype(original_dtype)
或np.asarray(categorical)
:
In [20]: s = pd.Series(["a","b","c","a"])
In [21]: s
Out[21]:
0 a
1 b
2 c
3 a
dtype: object
In [22]: s2 = s.astype('category')
In [23]: s2
Out[23]:
0 a
1 b
2 c
3 a
dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
In [24]: s3 = s2.astype('string')
In [25]: s3
Out[25]:
0 a
1 b
2 c
3 a
dtype: object
In [26]: np.asarray(s2)
Out[26]: array(['a', 'b', 'c', 'a'], dtype=object)
如果您已经具有代码和类别,则可以使用from_codes()
构造函数在正常构造函数模式下保存factorize步骤:
In [27]: splitter = np.random.choice([0,1], 5, p=[0.5,0.5])
In [28]: s = pd.Series(pd.Categorical.from_codes(splitter, categories=["train", "test"]))
Description¶
对分类数据使用.describe()
将产生与string
类型的Series或DataFrame类似的输出。
In [29]: cat = pd.Categorical(["a", "c", "c", np.nan], categories=["b", "a", "c"])
In [30]: df = pd.DataFrame({"cat":cat, "s":["a", "c", "c", np.nan]})
In [31]: df.describe()
Out[31]:
cat s
count 3 3
unique 2 2
top c c
freq 2 2
In [32]: df["cat"].describe()
Out[32]:
count 3
unique 2
top c
freq 2
Name: cat, dtype: object
Working with categories¶
分类数据具有类别和有序属性,其中列出了其可能的值以及顺序是否重要。这些属性显示为s.cat.categories
和s.cat.ordered
。如果不手动指定类别和顺序,则从传递的值推断它们。
In [33]: s = pd.Series(["a","b","c","a"], dtype="category")
In [34]: s.cat.categories
Out[34]: Index([u'a', u'b', u'c'], dtype='object')
In [35]: s.cat.ordered
Out[35]: False
还可以按特定顺序传入类别:
In [36]: s = pd.Series(pd.Categorical(["a","b","c","a"], categories=["c","b","a"]))
In [37]: s.cat.categories
Out[37]: Index([u'c', u'b', u'a'], dtype='object')
In [38]: s.cat.ordered
Out[38]: False
注意
新的分类数据不会自动排序。您必须明确传递ordered=True
以指示有序的Categorical
。
注意
Series.unique()
的结果并不总是与Series.cat.categories
相同,因为Series.unique()
的保证,即它按出现顺序返回类别,并且它仅包括实际存在的值。
In [39]: s = pd.Series(list('babc')).astype('category', categories=list('abcd'))
In [40]: s
Out[40]:
0 b
1 a
2 b
3 c
dtype: category
Categories (4, object): [a, b, c, d]
# categories
In [41]: s.cat.categories
Out[41]: Index([u'a', u'b', u'c', u'd'], dtype='object')
# uniques
In [42]: s.unique()
Out[42]:
[b, a, c]
Categories (3, object): [b, a, c]
Renaming categories¶
通过向Series.cat.categories
属性分配新值或使用Categorical.rename_categories()
方法重命名类别:
In [43]: s = pd.Series(["a","b","c","a"], dtype="category")
In [44]: s
Out[44]:
0 a
1 b
2 c
3 a
dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
In [45]: s.cat.categories = ["Group %s" % g for g in s.cat.categories]
In [46]: s
Out[46]:
0 Group a
1 Group b
2 Group c
3 Group a
dtype: category
Categories (3, object): [Group a, Group b, Group c]
In [47]: s.cat.rename_categories([1,2,3])
Out[47]:
0 1
1 2
2 3
3 1
dtype: category
Categories (3, int64): [1, 2, 3]
注意
与R的因子相反,分类数据可以具有除字符串之外的其他类型的类别。
注意
请注意,分配新类别是一个内部操作,而大多数Series.cat
下的其他操作默认返回一系列新的类型类别。
类别必须是唯一的或产生ValueError:
In [48]: try:
....: s.cat.categories = [1,1,1]
....: except ValueError as e:
....: print("ValueError: " + str(e))
....:
ValueError: Categorical categories must be unique
Appending new categories¶
可以使用Categorical.add_categories()
方法来追加类别:
In [49]: s = s.cat.add_categories([4])
In [50]: s.cat.categories
Out[50]: Index([u'Group a', u'Group b', u'Group c', 4], dtype='object')
In [51]: s
Out[51]:
0 Group a
1 Group b
2 Group c
3 Group a
dtype: category
Categories (4, object): [Group a, Group b, Group c, 4]
Removing categories¶
可以使用Categorical.remove_categories()
方法来删除类别。删除的值将替换为np.nan
。:
In [52]: s = s.cat.remove_categories([4])
In [53]: s
Out[53]:
0 Group a
1 Group b
2 Group c
3 Group a
dtype: category
Categories (3, object): [Group a, Group b, Group c]
Removing unused categories¶
删除未使用的类别也可以:
In [54]: s = pd.Series(pd.Categorical(["a","b","a"], categories=["a","b","c","d"]))
In [55]: s
Out[55]:
0 a
1 b
2 a
dtype: category
Categories (4, object): [a, b, c, d]
In [56]: s.cat.remove_unused_categories()
Out[56]:
0 a
1 b
2 a
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
Setting categories¶
如果您希望在一个步骤中删除并添加新类别(具有一些速度优势),或只是将类别设置为预定义的比例,请使用Categorical.set_categories()
。
In [57]: s = pd.Series(["one","two","four", "-"], dtype="category")
In [58]: s
Out[58]:
0 one
1 two
2 four
3 -
dtype: category
Categories (4, object): [-, four, one, two]
In [59]: s = s.cat.set_categories(["one","two","three","four"])
In [60]: s
Out[60]:
0 one
1 two
2 four
3 NaN
dtype: category
Categories (4, object): [one, two, three, four]
注意
请注意,Categorical.set_categories()
无法知道某个类别是否被有意省略,或者因为类型差异(例如numpys S1 dtype和python字符串)而拼写错误或(在Python3下)。
Sorting and Order¶
警告
默认的构造在v0.16.0中从先前隐式的ordered=True
改变为ordered=False
如果对类别数据排序(s.cat.ordered == True
),具有含义并且某些操作是可能的。如果分类是无序的,.min()/.max()
会引发一个TypeError。
In [61]: s = pd.Series(pd.Categorical(["a","b","c","a"], ordered=False))
In [62]: s.sort_values(inplace=True)
In [63]: s = pd.Series(["a","b","c","a"]).astype('category', ordered=True)
In [64]: s.sort_values(inplace=True)
In [65]: s
Out[65]:
0 a
3 a
1 b
2 c
dtype: category
Categories (3, object): [a < b < c]
In [66]: s.min(), s.max()
Out[66]: ('a', 'c')
您可以使用as_ordered()
或使用as_unordered()
无序排序设置要排序的分类数据。这些将默认返回新对象。
In [67]: s.cat.as_ordered()
Out[67]:
0 a
3 a
1 b
2 c
dtype: category
Categories (3, object): [a < b < c]
In [68]: s.cat.as_unordered()
Out[68]:
0 a
3 a
1 b
2 c
dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
排序将使用类别定义的顺序,而不是数据类型上存在的任何词法顺序。这对于字符串和数字数据是正确的:
In [69]: s = pd.Series([1,2,3,1], dtype="category")
In [70]: s = s.cat.set_categories([2,3,1], ordered=True)
In [71]: s
Out[71]:
0 1
1 2
2 3
3 1
dtype: category
Categories (3, int64): [2 < 3 < 1]
In [72]: s.sort_values(inplace=True)
In [73]: s
Out[73]:
1 2
2 3
0 1
3 1
dtype: category
Categories (3, int64): [2 < 3 < 1]
In [74]: s.min(), s.max()
Out[74]: (2, 1)
Reordering¶
可以通过Categorical.reorder_categories()
和Categorical.set_categories()
方法重新排序类别。对于Categorical.reorder_categories()
,所有旧类别都必须包含在新类别中,不允许使用新类别。这将必然使排序顺序与类别顺序相同。
In [75]: s = pd.Series([1,2,3,1], dtype="category")
In [76]: s = s.cat.reorder_categories([2,3,1], ordered=True)
In [77]: s
Out[77]:
0 1
1 2
2 3
3 1
dtype: category
Categories (3, int64): [2 < 3 < 1]
In [78]: s.sort_values(inplace=True)
In [79]: s
Out[79]:
1 2
2 3
0 1
3 1
dtype: category
Categories (3, int64): [2 < 3 < 1]
In [80]: s.min(), s.max()
Out[80]: (2, 1)
注意
请注意分配新类别和重新排序类别之间的差异:首先重命名类别,因此在系列中的各个值,但如果第一个位置最后排序,重命名的值仍将最后排序。重新排序意味着值的排序方式不同,但不是系列中的单个值发生更改。
注意
如果分类未排序,Series.min()
和Series.max()
会引发TypeError
。像+
,-
,*
,/
和基于它们的操作(例如Series.median()
,如果数组的长度是偶数,则需要计算两个值之间的平均值)不起作用,并产生TypeError
。
Multi Column Sorting¶
分类类型列将以与其他列类似的方式参与多列排序。分类的排序由该列的categories
确定。
In [81]: dfs = pd.DataFrame({'A' : pd.Categorical(list('bbeebbaa'), categories=['e','a','b'], ordered=True),
....: 'B' : [1,2,1,2,2,1,2,1] })
....:
In [82]: dfs.sort_values(by=['A', 'B'])
Out[82]:
A B
2 e 1
3 e 2
7 a 1
6 a 2
0 b 1
5 b 1
1 b 2
4 b 2
重新排序categories
会更改未来排序。
In [83]: dfs['A'] = dfs['A'].cat.reorder_categories(['a','b','e'])
In [84]: dfs.sort_values(by=['A','B'])
Out[84]:
A B
7 a 1
6 a 2
0 b 1
5 b 1
1 b 2
4 b 2
2 e 1
3 e 2
Comparisons¶
在三种情况下可以比较分类数据与其他对象:
- 将等式(
==
和!=
)与类别对象(列表,系列,数组,...)进行比较,其长度与分类数据相同。- all comparisons (
==
,!=
,>
,>=
,<
, and<=
) of categorical data to another categorical Series, whenordered==True
and the categories are the same.- 分类数据与标量的所有比较。
所有其他比较,特别是具有不同类别的两个分类的“非等同”比较,或者具有任何类似列表的对象的分类,将引起TypeError。
注意
对分类数据与系列,np.array,列表或具有不同类别或排序的分类数据的任何“不等同”比较TypeError,因为自定义类别排序可以用两种方式解释:一种考虑到排序,一种没有。
In [85]: cat = pd.Series([1,2,3]).astype("category", categories=[3,2,1], ordered=True)
In [86]: cat_base = pd.Series([2,2,2]).astype("category", categories=[3,2,1], ordered=True)
In [87]: cat_base2 = pd.Series([2,2,2]).astype("category", ordered=True)
In [88]: cat
Out[88]:
0 1
1 2
2 3
dtype: category
Categories (3, int64): [3 < 2 < 1]
In [89]: cat_base
Out[89]:
0 2
1 2
2 2
dtype: category
Categories (3, int64): [3 < 2 < 1]
In [90]: cat_base2
Out[90]:
0 2
1 2
2 2
dtype: category
Categories (1, int64): [2]
比较具有相同类别和排序或标量作品的分类:
In [91]: cat > cat_base
Out[91]:
0 True
1 False
2 False
dtype: bool
In [92]: cat > 2
Out[92]:
0 True
1 False
2 False
dtype: bool
平等比较与任何相同长度和标量的类似列表对象一起使用:
In [93]: cat == cat_base
Out[93]:
0 False
1 True
2 False
dtype: bool
In [94]: cat == np.array([1,2,3])
Out[94]:
0 True
1 True
2 True
dtype: bool
In [95]: cat == 2
Out[95]:
0 False
1 True
2 False
dtype: bool
这不工作,因为类别不一样:
In [96]: try:
....: cat > cat_base2
....: except TypeError as e:
....: print("TypeError: " + str(e))
....:
TypeError: Categoricals can only be compared if 'categories' are the same
如果要对类别序列与不是分类数据的类似列表对象执行“非等同”比较,则需要显式并将分类数据转换回原始值:
In [97]: base = np.array([1,2,3])
In [98]: try:
....: cat > base
....: except TypeError as e:
....: print("TypeError: " + str(e))
....:
TypeError: Cannot compare a Categorical for op __gt__ with type <type 'numpy.ndarray'>.
If you want to compare values, use 'np.asarray(cat) <op> other'.
In [99]: np.asarray(cat) > base
Out[99]: array([False, False, False], dtype=bool)
Operations¶
除了Series.min()
,Series.max()
和Series.mode()
,以下操作对于分类数据是可能的:
Series.value_counts()的系列方法将使用所有类别,即使数据中不存在某些类别:
In [100]: s = pd.Series(pd.Categorical(["a","b","c","c"], categories=["c","a","b","d"]))
In [101]: s.value_counts()
Out[101]:
c 2
b 1
a 1
d 0
dtype: int64
Groupby还将显示“未使用”类别:
In [102]: cats = pd.Categorical(["a","b","b","b","c","c","c"], categories=["a","b","c","d"])
In [103]: df = pd.DataFrame({"cats":cats,"values":[1,2,2,2,3,4,5]})
In [104]: df.groupby("cats").mean()
Out[104]:
values
cats
a 1.0
b 2.0
c 4.0
d NaN
In [105]: cats2 = pd.Categorical(["a","a","b","b"], categories=["a","b","c"])
In [106]: df2 = pd.DataFrame({"cats":cats2,"B":["c","d","c","d"], "values":[1,2,3,4]})
In [107]: df2.groupby(["cats","B"]).mean()
Out[107]:
values
cats B
a c 1.0
d 2.0
b c 3.0
d 4.0
c c NaN
d NaN
数据透视表:
In [108]: raw_cat = pd.Categorical(["a","a","b","b"], categories=["a","b","c"])
In [109]: df = pd.DataFrame({"A":raw_cat,"B":["c","d","c","d"], "values":[1,2,3,4]})
In [110]: pd.pivot_table(df, values='values', index=['A', 'B'])
Out[110]:
A B
a c 1.0
d 2.0
b c 3.0
d 4.0
c c NaN
d NaN
Name: values, dtype: float64
Data munging¶
优化的pandas数据访问方法.loc
,.iloc
,.ix
.at
和.iat
,正常工作。唯一的区别是返回类型(用于获取),并且只能分配类别中的值。
Getting¶
如果切片操作返回DataFrame或类型系列的列,则会保留category
dtype。
In [111]: idx = pd.Index(["h","i","j","k","l","m","n",])
In [112]: cats = pd.Series(["a","b","b","b","c","c","c"], dtype="category", index=idx)
In [113]: values= [1,2,2,2,3,4,5]
In [114]: df = pd.DataFrame({"cats":cats,"values":values}, index=idx)
In [115]: df.iloc[2:4,:]
Out[115]:
cats values
j b 2
k b 2
In [116]: df.iloc[2:4,:].dtypes
Out[116]:
cats category
values int64
dtype: object
In [117]: df.loc["h":"j","cats"]
Out[117]:
h a
i b
j b
Name: cats, dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
In [118]: df.ix["h":"j",0:1]
Out[118]:
cats
h a
i b
j b
In [119]: df[df["cats"] == "b"]
Out[119]:
cats values
i b 2
j b 2
k b 2
未保留类别类型的示例是,如果您只需要一行:生成的Series是dtype object
:
# get the complete "h" row as a Series
In [120]: df.loc["h", :]
Out[120]:
cats a
values 1
Name: h, dtype: object
从分类数据返回单个项目也将返回值,而不是长度为“1”的分类。
In [121]: df.iat[0,0]
Out[121]: 'a'
In [122]: df["cats"].cat.categories = ["x","y","z"]
In [123]: df.at["h","cats"] # returns a string
Out[123]: 'x'
注意
这与R的因子函数不同,其中factor(c(1,2,3))[1]
返回单个值。
要获取类型category
类型的单个值Series,请传入具有单个值的列表:
In [124]: df.loc[["h"],"cats"]
Out[124]:
h x
Name: cats, dtype: category
Categories (3, object): [x, y, z]
String and datetime accessors¶
版本0.17.1中的新功能。
如果s.cat.categories
是适当类型,则访问器.dt
和.str
In [125]: str_s = pd.Series(list('aabb'))
In [126]: str_cat = str_s.astype('category')
In [127]: str_cat
Out[127]:
0 a
1 a
2 b
3 b
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
In [128]: str_cat.str.contains("a")
Out[128]:
0 True
1 True
2 False
3 False
dtype: bool
In [129]: date_s = pd.Series(pd.date_range('1/1/2015', periods=5))
In [130]: date_cat = date_s.astype('category')
In [131]: date_cat
Out[131]:
0 2015-01-01
1 2015-01-02
2 2015-01-03
3 2015-01-04
4 2015-01-05
dtype: category
Categories (5, datetime64[ns]): [2015-01-01, 2015-01-02, 2015-01-03, 2015-01-04, 2015-01-05]
In [132]: date_cat.dt.day
Out[132]:
0 1
1 2
2 3
3 4
4 5
dtype: int64
注意
The returned Series
(or DataFrame
) is of the same type as if you used the .str.<method>
/ .dt.<method>
on a Series
of that type (and not of type category
! )。
这意味着,从Series
的访问器上的方法和属性返回的值以及此Series
的访问器上的方法和属性的返回值都转换为类型之一类别将相等:
In [133]: ret_s = str_s.str.contains("a")
In [134]: ret_cat = str_cat.str.contains("a")
In [135]: ret_s.dtype == ret_cat.dtype
Out[135]: True
In [136]: ret_s == ret_cat
Out[136]:
0 True
1 True
2 True
3 True
dtype: bool
注意
工作在categories
上完成,然后构建新的Series
。如果你有一个Series
类型字符串,其中很多元素被重复(即,Series
中的唯一元素的数量比Series
的长度)。在这种情况下,将原始Series
转换为category
之一并使用.str.<method>
或.dt.<property>
。
Setting¶
在分类列(或系列)中设置值可以工作,只要该值包含在类别中:
In [137]: idx = pd.Index(["h","i","j","k","l","m","n"])
In [138]: cats = pd.Categorical(["a","a","a","a","a","a","a"], categories=["a","b"])
In [139]: values = [1,1,1,1,1,1,1]
In [140]: df = pd.DataFrame({"cats":cats,"values":values}, index=idx)
In [141]: df.iloc[2:4,:] = [["b",2],["b",2]]
In [142]: df
Out[142]:
cats values
h a 1
i a 1
j b 2
k b 2
l a 1
m a 1
n a 1
In [143]: try:
.....: df.iloc[2:4,:] = [["c",3],["c",3]]
.....: except ValueError as e:
.....: print("ValueError: " + str(e))
.....:
ValueError: Cannot setitem on a Categorical with a new category, set the categories first
通过指定分类数据设置值还将检查类别是否匹配:
In [144]: df.loc["j":"k","cats"] = pd.Categorical(["a","a"], categories=["a","b"])
In [145]: df
Out[145]:
cats values
h a 1
i a 1
j a 2
k a 2
l a 1
m a 1
n a 1
In [146]: try:
.....: df.loc["j":"k","cats"] = pd.Categorical(["b","b"], categories=["a","b","c"])
.....: except ValueError as e:
.....: print("ValueError: " + str(e))
.....:
ValueError: Cannot set a Categorical with another, without identical categories
为其他类型的列的某些部分分配分类将使用以下值:
In [147]: df = pd.DataFrame({"a":[1,1,1,1,1], "b":["a","a","a","a","a"]})
In [148]: df.loc[1:2,"a"] = pd.Categorical(["b","b"], categories=["a","b"])
In [149]: df.loc[2:3,"b"] = pd.Categorical(["b","b"], categories=["a","b"])
In [150]: df
Out[150]:
a b
0 1 a
1 b a
2 b b
3 1 b
4 1 a
In [151]: df.dtypes
Out[151]:
a object
b object
dtype: object
Merging¶
您可以将包含分类数据的两个DataFrames合并在一起,但这些分类的类别需要相同:
In [152]: cat = pd.Series(["a","b"], dtype="category")
In [153]: vals = [1,2]
In [154]: df = pd.DataFrame({"cats":cat, "vals":vals})
In [155]: res = pd.concat([df,df])
In [156]: res
Out[156]:
cats vals
0 a 1
1 b 2
0 a 1
1 b 2
In [157]: res.dtypes
Out[157]:
cats category
vals int64
dtype: object
在这种情况下,类别不一样,因此会出现错误:
In [158]: df_different = df.copy()
In [159]: df_different["cats"].cat.categories = ["c","d"]
In [160]: try:
.....: pd.concat([df,df_different])
.....: except ValueError as e:
.....: print("ValueError: " + str(e))
.....:
这同样适用于df.append(df_different)
。
Unioning¶
版本0.19.0中的新功能。
如果要组合不一定具有相同类别的类别,union_categoricals
函数将组合类似列表的类别。新类别将是合并的类别的并集。
In [161]: from pandas.types.concat import union_categoricals
In [162]: a = pd.Categorical(["b", "c"])
In [163]: b = pd.Categorical(["a", "b"])
In [164]: union_categoricals([a, b])
Out[164]:
[b, c, a, b]
Categories (3, object): [b, c, a]
默认情况下,生成的类别将按照在数据中显示的顺序排列。如果要对类别进行排序,请使用sort_categories=True
参数。
In [165]: union_categoricals([a, b], sort_categories=True)
Out[165]:
[b, c, a, b]
Categories (3, object): [a, b, c]
union_categoricals
也适用于组合相同类别和顺序信息的两个分类(例如,您也可以append
)的“简单”情况。
In [166]: a = pd.Categorical(["a", "b"], ordered=True)
In [167]: b = pd.Categorical(["a", "b", "a"], ordered=True)
In [168]: union_categoricals([a, b])
Out[168]:
[a, b, a, b, a]
Categories (2, object): [a < b]
以下引发TypeError
,因为类别是有序的并且不相同。
In [1]: a = pd.Categorical(["a", "b"], ordered=True)
In [2]: b = pd.Categorical(["a", "b", "c"], ordered=True)
In [3]: union_categoricals([a, b])
Out[3]:
TypeError: to union ordered Categoricals, all categories must be the same
union_categoricals
也适用于包含分类数据的CategoricalIndex
或Series
,但请注意,生成的数组将始终是一个简单的Categorical
In [169]: a = pd.Series(["b", "c"], dtype='category')
In [170]: b = pd.Series(["a", "b"], dtype='category')
In [171]: union_categoricals([a, b])
Out[171]:
[b, c, a, b]
Categories (3, object): [b, c, a]
注意
union_categoricals
可以在合并分类时重新编码类别的整数代码。这可能是你想要的,但如果你依赖于类别的确切编号,请注意。
In [172]: c1 = pd.Categorical(["b", "c"])
In [173]: c2 = pd.Categorical(["a", "b"])
In [174]: c1
Out[174]:
[b, c]
Categories (2, object): [b, c]
# "b" is coded to 0
In [175]: c1.codes
Out[175]: array([0, 1], dtype=int8)
In [176]: c2
Out[176]:
[a, b]
Categories (2, object): [a, b]
# "b" is coded to 1
In [177]: c2.codes
Out[177]: array([0, 1], dtype=int8)
In [178]: c = union_categoricals([c1, c2])
In [179]: c
Out[179]:
[b, c, a, b]
Categories (3, object): [b, c, a]
# "b" is coded to 0 throughout, same as c1, different from c2
In [180]: c.codes
Out[180]: array([0, 1, 2, 0], dtype=int8)
Concatenation¶
本节介绍category
dtype特有的连接。有关一般说明,请参阅Concatenating objects。
默认情况下,包含相同类别的Series
或DataFrame
连接会导致category
dtype,否则会导致object
dtype 。使用.astype
或union_categoricals
可获取category
结果。
# same categories
In [181]: s1 = pd.Series(['a', 'b'], dtype='category')
In [182]: s2 = pd.Series(['a', 'b', 'a'], dtype='category')
In [183]: pd.concat([s1, s2])
Out[183]:
0 a
1 b
0 a
1 b
2 a
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
# different categories
In [184]: s3 = pd.Series(['b', 'c'], dtype='category')
In [185]: pd.concat([s1, s3])
Out[185]:
0 a
1 b
0 b
1 c
dtype: object
In [186]: pd.concat([s1, s3]).astype('category')
Out[186]:
0 a
1 b
0 b
1 c
dtype: category
Categories (3, object): [a, b, c]
In [187]: union_categoricals([s1.values, s3.values])
Out[187]:
[a, b, b, c]
Categories (3, object): [a, b, c]
下表总结了Categoricals
相关并置的结果。
arg1 | arg2 | 结果 |
---|---|---|
类别 | 类别(相同类别) | 类别 |
类别 | 类别(不同类别,均未排序) | 对象(dtype被推断) |
类别 | 类别(不同类别,任一个是有序的) | 对象(dtype被推断) |
类别 | 不是类别 | 对象(dtype被推断) |
Getting Data In/Out¶
版本0.15.2中的新功能。
将数据(系列,帧)写入到包含category
dtype的HDF存储中,在0.15.2中实现。有关示例和警告,请参见here。
在0.15.2中实现向Stata格式文件写入数据和从中读取数据。有关示例和警告,请参见here。
写入CSV文件将转换数据,有效地删除有关分类(类别和排序)的任何信息。因此,如果您读回CSV文件,则必须将相关列转换回类别,并分配正确的类别和类别顺序。
In [188]: s = pd.Series(pd.Categorical(['a', 'b', 'b', 'a', 'a', 'd']))
# rename the categories
In [189]: s.cat.categories = ["very good", "good", "bad"]
# reorder the categories and add missing categories
In [190]: s = s.cat.set_categories(["very bad", "bad", "medium", "good", "very good"])
In [191]: df = pd.DataFrame({"cats":s, "vals":[1,2,3,4,5,6]})
In [192]: csv = StringIO()
In [193]: df.to_csv(csv)
In [194]: df2 = pd.read_csv(StringIO(csv.getvalue()))
In [195]: df2.dtypes
Out[195]:
Unnamed: 0 int64
cats object
vals int64
dtype: object
In [196]: df2["cats"]
Out[196]:
0 very good
1 good
2 good
3 very good
4 very good
5 bad
Name: cats, dtype: object
# Redo the category
In [197]: df2["cats"] = df2["cats"].astype("category")
In [198]: df2["cats"].cat.set_categories(["very bad", "bad", "medium", "good", "very good"],
.....: inplace=True)
.....:
In [199]: df2.dtypes
Out[199]:
Unnamed: 0 int64
cats category
vals int64
dtype: object
In [200]: df2["cats"]
Out[200]:
0 very good
1 good
2 good
3 very good
4 very good
5 bad
Name: cats, dtype: category
Categories (5, object): [very bad, bad, medium, good, very good]
这同样适用于使用to_sql
写入SQL数据库。
Missing Data¶
pandas主要使用值np.nan来表示缺失的数据。它默认不包括在计算中。请参阅Missing Data section。
Missing values should not be included in the Categorical’s categories
, only in the values
. 相反,应当理解NaN是不同的,并且总是一种可能性。使用分类的codes
时,缺少的值将始终具有-1
的代码。
In [201]: s = pd.Series(["a", "b", np.nan, "a"], dtype="category")
# only two categories
In [202]: s
Out[202]:
0 a
1 b
2 NaN
3 a
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
In [203]: s.cat.codes
Out[203]:
0 0
1 1
2 -1
3 0
dtype: int8
处理缺失数据的方法,例如isnull()
,fillna()
,dropna()
In [204]: s = pd.Series(["a", "b", np.nan], dtype="category")
In [205]: s
Out[205]:
0 a
1 b
2 NaN
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
In [206]: pd.isnull(s)
Out[206]:
0 False
1 False
2 True
dtype: bool
In [207]: s.fillna("a")
Out[207]:
0 a
1 b
2 a
dtype: category
Categories (2, object): [a, b]
Differences to R’s factor¶
可以观察到以下与R的因子函数的差异:
- R的级别被命名为类别
- R的级别始终为字符串类型,而pandas中的类别可以是任何类型。
- 在创建时无法指定标签。之后使用
s.cat.rename_categories(new_labels)
。 - 与R的因子函数相反,使用分类数据作为创建新类别序列的唯一输入,不会删除未使用的类别,但创建一个新的类别序列,通过一个!
- R允许在其级别(pandas'类别)中包含缺失值。Pandas不允许NaN类别,但是缺少的值仍然可以在值中。
Gotchas¶
Memory Usage¶
Categorical
的内存使用量与类别数量乘以数据长度成正比。相反,object
dtype是一个常数乘以数据长度。
In [208]: s = pd.Series(['foo','bar']*1000)
# object dtype
In [209]: s.nbytes
Out[209]: 16000
# category dtype
In [210]: s.astype('category').nbytes
Out[210]: 2016
注意
如果类别数接近数据长度,则Categorical
将使用与等同的object
dtype表示近似相同或更多的存储器。
In [211]: s = pd.Series(['foo%04d' % i for i in range(2000)])
# object dtype
In [212]: s.nbytes
Out[212]: 16000
# category dtype
In [213]: s.astype('category').nbytes
Out[213]: 20000
Old style constructor usage¶
在早于pandas 0.15的版本中,可以通过传递预先计算的代码(称为标签)而不是类别值来构建分类。代码被解释为指向-1作为NaN的类别的指针。这种类型的构造函数用法由特殊构造函数Categorical.from_codes()
替换。
不幸的是,在一些特殊情况下,使用代码假定旧样式构造函数使用将与当前的熊猫版本,将导致一些微妙的错误:
>>> cat = pd.Categorical([1,2], [1,2,3])
>>> # old version
>>> cat.get_values()
array([2, 3], dtype=int64)
>>> # new version
>>> cat.get_values()
array([1, 2], dtype=int64)
警告
如果您对旧版本的pandas使用分类,请在升级前审核您的代码,并更改代码以使用from_codes()
构造函数。
Categorical is not a numpy array¶
目前,分类数据和底层分类实现为python对象,而不是低级numpy数组dtype。这导致一些问题。
numpy本身不知道新的dtype:
In [214]: try:
.....: np.dtype("category")
.....: except TypeError as e:
.....: print("TypeError: " + str(e))
.....:
TypeError: data type "category" not understood
In [215]: dtype = pd.Categorical(["a"]).dtype
In [216]: try:
.....: np.dtype(dtype)
.....: except TypeError as e:
.....: print("TypeError: " + str(e))
.....:
TypeError: data type not understood
Dtype比较工作:
In [217]: dtype == np.str_
Out[217]: False
In [218]: np.str_ == dtype
Out[218]: False
要检查系列是否包含分类数据,使用pandas 0.16或更高版本,请使用hasattr(s, 'cat')
In [219]: hasattr(pd.Series(['a'], dtype='category'), 'cat')
Out[219]: True
In [220]: hasattr(pd.Series(['a']), 'cat')
Out[220]: False
在类型category
的系列上使用numpy功能不应该工作,因为分类不是数字数据.categories
是数字的情况)。
In [221]: s = pd.Series(pd.Categorical([1,2,3,4]))
In [222]: try:
.....: np.sum(s)
.....: except TypeError as e:
.....: print("TypeError: " + str(e))
.....:
TypeError: Categorical cannot perform the operation sum
注意
如果这样的功能工作,请在https://github.com/pandas-dev/pandas提交错误!
dtype in apply¶
Pandas目前在应用函数中不保留dtype:如果沿行应用,您将获得object
dtype的系列 - >获取一个元素将返回一个基本类型),沿列应用也将转换为对象。
In [223]: df = pd.DataFrame({"a":[1,2,3,4],
.....: "b":["a","b","c","d"],
.....: "cats":pd.Categorical([1,2,3,2])})
.....:
In [224]: df.apply(lambda row: type(row["cats"]), axis=1)
Out[224]:
0 <type 'int'>
1 <type 'int'>
2 <type 'int'>
3 <type 'int'>
dtype: object
In [225]: df.apply(lambda col: col.dtype, axis=0)
Out[225]:
a object
b object
cats object
dtype: object
Categorical Index¶
版本0.16.1中的新功能。
在版本0.16.1中引入了新的CategoricalIndex
索引类型。有关详细说明,请参阅advanced indexing docs。
设置索引,将创建CategoricalIndex
In [226]: cats = pd.Categorical([1,2,3,4], categories=[4,2,3,1])
In [227]: strings = ["a","b","c","d"]
In [228]: values = [4,2,3,1]
In [229]: df = pd.DataFrame({"strings":strings, "values":values}, index=cats)
In [230]: df.index
Out[230]: CategoricalIndex([1, 2, 3, 4], categories=[4, 2, 3, 1], ordered=False, dtype='category')
# This now sorts by the categories order
In [231]: df.sort_index()
Out[231]:
strings values
4 d 1
2 b 2
3 c 3
1 a 4
In previous versions (<0.16.1) there is no index of type category
, so setting the index to categorical column will convert the categorical data to a “normal” dtype first and therefore remove any custom ordering of the categories.
Side Effects¶
从分类构造系列将不会复制输入分类。这意味着更改系列将在大多数情况下更改原始分类:
In [232]: cat = pd.Categorical([1,2,3,10], categories=[1,2,3,4,10])
In [233]: s = pd.Series(cat, name="cat")
In [234]: cat
Out[234]:
[1, 2, 3, 10]
Categories (5, int64): [1, 2, 3, 4, 10]
In [235]: s.iloc[0:2] = 10
In [236]: cat
Out[236]:
[10, 10, 3, 10]
Categories (5, int64): [1, 2, 3, 4, 10]
In [237]: df = pd.DataFrame(s)
In [238]: df["cat"].cat.categories = [1,2,3,4,5]
In [239]: cat
Out[239]:
[5, 5, 3, 5]
Categories (5, int64): [1, 2, 3, 4, 5]
使用copy=True
可防止此类行为或仅仅不重复使用分类:
In [240]: cat = pd.Categorical([1,2,3,10], categories=[1,2,3,4,10])
In [241]: s = pd.Series(cat, name="cat", copy=True)
In [242]: cat
Out[242]:
[1, 2, 3, 10]
Categories (5, int64): [1, 2, 3, 4, 10]
In [243]: s.iloc[0:2] = 10
In [244]: cat
Out[244]:
[1, 2, 3, 10]
Categories (5, int64): [1, 2, 3, 4, 10]
注意
在某些情况下,当你提供一个numpy数组而不是分类:使用一个int数组(例如np.array([1,2,3,4])
)将显示相同的行为,同时使用字符串数组(例如np.array(["a","b","c","a"])